Vyššia vstupná investícia
Inštalácia fotovoltiky predstavuje jednorazový väčší výdavok. Aj keď ceny technológie postupne klesajú, kompletný systém (panely, menič, konštrukcia, batéria, montáž) vie stáť niekoľko tisíc eur. Dôležité však je vysvetliť, že ide o investíciu, nie spotrebu – návratnosť sa pri bežných domácnostiach pohybuje približne v horizonte 4–10 rokov (bez dotácie dlhšie).
Závislosť od podmienok – orientácia a tieň
Výkon FVE výrazne ovplyvňuje to, akým smerom je orientovaná strecha, jej sklon a prípadné tienenie od stromov či budov. Ak panel dopadá tieň čo i len na časť dňa, môže to znížiť výkon celého stringu panelov. Preto je dôležitý kvalitný návrh a niekedy aj použitie optimizérov.
Výkon kolíše podľa ročného obdobia
Fotovoltika robí najviac energie v lete, najmenej v zime. V praxi to znamená: v lete býva prebytok, v zime stále budete potrebovať energiu zo siete. Treba otvorene povedať, že fotovoltika nenahradí elektrinu na 100 % počas celého roka, pokiaľ sa nevyužívajú batérie alebo špecifické režimy.